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    时时开奖号码: 贯善生物自主开发二三代混合组装软件 AssembleSAT3.0

    广州贯善生物科技有限公司2016年11月16日 13:38 点击:994

    时时彩网络平台 www.qlgr.net     我司生物信息分析工程师王博借鉴国内外经验,历时两年自主开发了“Assemble SAT3.0” 二三代混合组装软件。该应用软件在基因组杂合度>0.5%或重复序列>50%的二倍体物种或多倍体物种进行从头测序并进行拼接、组装,对比SOAPdenovo2,在计算时间和内存空间的消耗同等情况下,组装质量提高10%。


        王博介绍,二三代混合组装软件已成为动植物基因组组装的重要一环。近年来,动植物基因组组装数量井喷式上涨。至今国外内组装的动植物基因组数据已超300个,覆盖人、大鼠、小鼠、拟南芥、斑马鱼等物种。


        王博同时提到Assemble SAT3.0软件是一个综合的平台,包括算法、软件和策略。


        多组测序数据的测试表明:贯善自主开发二三代混合组装软件Assemble SAT3.0,实现对三代进行自纠错组装纠错数据(纯三代组装);二代数据组装;二三代联合组装;三代数据构建scaffold,二代数据构建scaffold;二代数据补洞等功能。


    复杂基因组组装策略

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    (来源: 广州贯善生物科技有限公司


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